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原子（希臘語為άτομος或átomos，意為「不可分的」），是能區分出化學元素的最小粒子，是組成分子基本單元。「原子」一詞原本（在希臘語中）表示不能被分割成更小粒子的粒子，然而現代科學使用「原子」來命名這種事物是不嚴謹的，因為人類已進一步發現原子是由多種亞原子粒子組成的。這些粒子包括：

* 帶負電荷的電子，它極其微小，小到目前無法測量的程度，而且它是三種粒子中最輕的，質量大約是9.11x10-31千克。
* 帶正電荷的質子，其自由質量約是電子質量的1836倍（1.67x10-27千克），但束縛能會使質子的質量減少。
* 不帶電荷的中子，其自由質量約是電子質量的1839倍，並具有和質子近乎相同的物理大小。（直徑大約在2.5x10-15米這一級別上，不過質子和中子的「表面」還沒有非常明確的界定）

目前，科學家認為質子和中子還由更多種類的基本粒子組成。

質子和中子組成了緻密的、佔有原子絕大部分質量的原子核，因此被合稱核子。電子構成了電子雲，它佔據原子絕大部分的體積，圍繞著原子核分佈。

核電荷數或原子序數Z，是組成原子核的質子數。原子是非常微小的粒子。假設原子是球體的話，典型原子的直徑大約是10-8厘米，質量大約是10-23克。

原子的概念最初是由英國化學家約翰·道爾頓提出的。1803年他發表「原子說」，提出所有物質都是由原子構成。而直到1909年，歐內斯特·盧瑟福領導的金箔實驗才實證了原子的存在。